分享一篇发表在Anal. Chem.上的文章，题目为“Chemoproteomic Profiling of ATP-Binding Sites with Acid-Cleavable Photoreactive Adenosine Phosphate Probes”，通讯作者是来自山东大学药学院的蔡容教授，她的研究方向聚焦于基于小分子活性探针的蛋白质组学研究。这篇文章中，作者开发了可酸切割的光反应性ATP和ADP探针，用于ATP和ADP结合蛋白和结合位点的组学分析。

ATP通过其相互作用的蛋白在多种细胞过程中发挥关键作用。为了实现对ATP结合蛋白和结合位点的组学分析，作者设计了具有光反应性双吖丙啶基团和末端炔基把手的ATP光亲和探针，并且具有可酸切割的linker用于减少标记肽的修饰质量。考虑到许多ATP结合的蛋白也与ADP相互作用，作者同样设计了ADP光亲和探针，用于比较蛋白质对ATP和ADP的亲和力。

作者通过凝胶电泳实验确认了探针对细胞裂解液中蛋白的标记效果。随后通过基于质谱的化学蛋白质组学分析评估了光亲和探针在竞争性标记下分别鉴定的ATP和ADP结合蛋白，并分析了ATP和ADP结合蛋白的功能富集特征和基序偏好性。

在定量结果中，多种DDX解旋酶在ADP探针标记下的富集程度高于ATP探针标记。作者通过纯化重组蛋白的体外实验证明这一家族中DDX3X蛋白对ADP的结合力高于ATP，与探针标记结果一致。

总的来说，这篇文章中作者开发了一种可酸切割的ATP和ADP光交联探针，用于ATP和ADP结合位点的化学蛋白质组学分析。

本文作者：LCX

责任编辑：WYJ

DOI：10.1021/acs.analchem.5c06813

原文链接：https://doi.org/10.1021/acs.analchem.5c06813