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Nat. Methods | CRAFi-CCR2:监测CCR2配体时空动态的生物传感器

分享一篇发表在Nature Methods上的文章:Genetically encoded biosensor for monitoring spatiotemporal dynamics of CCR2 ligands in culture and in vivo,通讯作者是来自西湖大学的Kiryl D. Piatkevich研究员,该课题组的研究方向是研发和设计尖端分子和成像技术,用于分析、控制和修复复杂生物系统。


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趋化因子(如CCL2等)通过与G蛋白偶联受体(GPCR)CCR2结合,调控免疫细胞在发育、稳态和炎症中的迁移,是免疫系统的关键信号分子。然而,由于现有检测技术(如ELISA、质谱、qPCR)无法实时、动态、高分辨率地追踪体内趋化因子的时空分布,其在活体中的精确释放模式一直未被阐明。

为了解决这一难题,本文作者通过基因工程开发了遗传编码荧光传感器CRAFi-CCR2(Human Chemokine-Receptor Activation-based Fluorescent indicator-CCR2),首次实现了对CCR2配体(尤其是CCL2)在体外和体内的实时、高灵敏度、空间特异性监测,为研究免疫调控、神经炎症及肿瘤微环境提供了强大工具。CRAFi-CCR2传感器设计的原理是以人源CCR2B受体为骨架,在其第三胞内环插入环化绿色荧光蛋白(cpGFP),通过构象变化将配体结合信号转化为荧光信号。在传感器优化方面,作者通过定点突变的方式去筛选效果更好的linker和cpGFP结构域。


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然而,由于趋化因子价格太高且目前尚无针对CCR2的小分子激动剂,作者在进行大规模突变体筛选前,为了提高筛选效率并降低成本,将CellSorter设备改造成自动药物输送系统iDrug。该系统可以往96孔板的细胞中添加低至5 μL的配体溶液,并自动记录荧光强度的变化。


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使用该系统,作者筛选了~331个突变体,并获得CRAFi-CCR2,其响应mCCL2的荧光增加~300%,在星形胶质细胞中具有纳摩尔级别的亲和力(2.5 nM)。此外,为了进一步改善传感器的膜定位,作者将其与高尔基体输出运输信号(KGC)和内质网输出(ER2)序列融合。通过一系列的性能表征实验,作者证明了CRAFi-CCR2具有较高的特异性,仅响应CCR2配体(如CCL2、CCL7、CCL8等)。另外,作者还证明了CRAFi-CCR2的激活并不会影响下游的信号通路,例如钙动员和受体内化。


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在优化好方法后,作者在体外细胞炎症模型中实时监测CCL2释放,它们进行了17-20 小时的实时成像,并且在小鼠大脑中,观察到CCL2 信号响应的空间异质性,强调了免疫系统时空信号传导的复杂性。

综上所述,本文作者开发了一种生物传感器CRAFi-CCR2,首次实现了活细胞以及活体动物中趋化因子动态变化的实时监测。


本文作者:MB

责任编辑:LZ

DOI:10.1038/s41592-025-02742-y

原文链接:https://doi.org/10.1038/s41592-025-02742-y


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