分享一篇发表在Angewandte Chemie International Edition上的文章，标题是“One-Step Enrichment and Quantitative Analysis of In Vivo Protein Complexes via Dimethylpiperidine Cross-Linker DPST”，通讯作者是来自中国科学院大连物理化学研究所的张丽华老师和赵群老师，主要研究兴趣为蛋白质组学研究。

体内交联质谱（cross-linking mass spectrometry, XL-MS）和同位素标记定量蛋白质谱都是研究者理解生命体的动态过程的强力工具。然而，现有的XL-MS方法在富集过程中存在显著的样品损失，且重现性较差（20%-40%），限制了其在有限样品中的应用和精确定量。因此，作者希望开发一种⾮内源性、可一步富集且⽣物相容性的新型交联剂。

作者首先设计并合成了⼀系列烷基链长度不同的可富集的2,6-⼆甲基哌啶⼆琥珀酰亚胺酯（DPSn）交联剂，并使用牛血清白蛋白BSA作为模型蛋白验证交联剂的可行性，发现其中13碳链变体DPST的鉴定数目最多。并用神经母细胞瘤细胞进行TMT抗体的免疫荧光染色验证了DPST的膜渗透性。随后作者将DPST与多步富集交联法（BSP）和一步富集交联法（TBDSPP）进行比较，发现DPST在低样本量的实验中仍能高效鉴定交联肽段和蛋白质。

接下来，作者使用DPST对⼩⿏脑源性原代神经元的交联蛋白质组进行了研究，并总共鉴定到7,279个交联肽，对应于20,536个交联位点和1,949个交联蛋⽩。作者将DPST交联剂的⼀步富集优势与同位素标记技术相结合，设计并合成了⼀对同位素标记的交联剂DPST-H/L，成功量化了在NaAsO刺激下，应激颗粒形成过程中78对上调的PPIs，其中30种具有⾼可信度（p < 0.05），而在这30种PPI中，有63%之前已经被报道过。

总之，作者开发的DPST作为一种新型交联剂，可将一步富集与TMT高精度定量技术结合，显著提升了蛋白质相互作用研究的覆盖范围和精确性。其适用于小样本和动态环境的特点，使DPST在生物医学研究和药物开发中具有广泛的应用潜力。

本文作者：ZCL

责任编辑：LZ

DOI：10.1002/anie.202506832

原文链接：https://doi.org/10.1002/anie.202506832