有机定制合成网

上海凯康镁科技有限公司 电话:021-58341363 化合物定制询价
专注化合物定制合成服务

分子砌块库设计:高通量筛选化合物的合成与供应方案

在新药研发的早期阶段,分子砌块(Building Blocks)的质量和多样性直接决定了筛选命中率与先导化合物优化效率。一个设计合理的分子砌块库,能够为药物化学家提供丰富的"乐高积木",加速从苗头化合物到先导化合物的迭代过程。本文从库设计原则、合成策略到供应方案,系统介绍纳孚生物的分子砌块定制合成服务

一、分子砌块在新药研发中的价值

1.1 什么是分子砌块?

分子砌块是指带有反应性官能团(如氨基、羧基、卤素、硼酸/酯、醛基等)、可直接用于偶联反应构建更大分子的结构片段。它们是组合化学和并行合成的基本单元。

1.2 分子砌块的分类

类别官能团典型应用
胺类砌块-NH₂、-NHR酰胺键构建、还原胺化
羧酸砌块-COOH酰胺键、酯键构建
卤代砌块-F、-Cl、-Br、-ISuzuki偶联、Buchwald-Hartwig反应
硼酸/酯砌块-B(OH)₂、-BpinSuzuki-Miyaura偶联
醛/酮砌块-CHO、-C(O)R还原胺化、亚胺缩合
杂环砌块吲唑、吡唑、嘧啶等药物核心骨架构建
点击化学砌块N₃、炔基、DBCO、TCO生物偶联、探针构建

image-15-building-blocks-design

二、分子砌块库设计原则

2.1 多样性导向设计

高质量的分子砌块库应具备以下多样性维度:

  • 骨架多样性:涵盖不同杂环核心(吲哚、吡唑、嘧啶、喹啉等)

  • 官能团多样性:每个骨架提供多种反应性官能团变体

  • 立体化学多样性:提供手性纯砌块(R型和S型)

  • 物理化学性质多样性:覆盖不同的logP、MW、PSA范围

  • 新颖性:避免与商业库高度重叠,提供结构新颖的独特砌块

2.2 类药性考量

根据Lipinski五规则和Veber规则,分子砌块应满足:

参数建议范围理由
分子量100-350 Da为后续偶联和优化留出空间
氢键供体≤3避免终产物违反五规则
氢键受体体≤5同上
logP-1至3兼顾溶解性和透膜性
可旋转键≤3确保终产物刚性适中
反应位点1-2个正交反应性,避免副反应

2.3 靶向库设计

针对特定药物类别设计专属砌块子库:

  • 激酶抑制剂砌块库:嘌呤/嘧啶类似物、杂环并环骨架、铰链区结合片段

  • PROTAC砌块库:E3配体衍生物(CRBN、VHL配体)、连接子片段、靶标配体

  • ADC连接子砌块库:Val-Cit-PAB、MC-VCit-PABC、可裂解/不可裂解连接子前体

  • 共价药物砌块库:丙烯酰胺、氯乙酰胺、磺酰氟、氰基丙烯酰胺等亲电弹头

  • 多肽药物砌块库:非天然氨基酸、N-甲基氨基酸、D型氨基酸

三、合成策略

3.1 并行合成

利用自动化合成平台,同时进行数十至数百个砌块的合成:

  • 液相并行合成:适用于2-4步反应的砌块

  • 固载试剂/清除树脂:简化后处理,提高通量

  • 微波辅助合成:将反应时间从小时缩短至分钟

3.2 关键反应类型

反应砌块类型效率
Suzuki偶联芳基-芳基键高,底物范围广
Buchwald-HartwigC-N键中高,需优化配体
酰胺缩合酰胺键高,HATU/DIPEA
还原胺化C-N键高,NaBH₃CN/NaBH(OAc)₃
点击化学(CuAAC)三氮唑高,生物正交
SNAr反应C-O/C-N键中,需活化底物

3.3 质量标准

  • 纯度:≥95%(HPLC)

  • 结构确认:¹H NMR + LC-MS

  • 残留溶剂:符合ICH Q3C指南

  • 稳定性:提供储存条件建议和稳定性数据

  • 批次一致性:建立标准化合成SOP

四、凯康镁科技的分子砌块定制服务

4.1 服务模式

模式描述适用客户
定制合成按客户指定结构合成有明确结构需求的研发团队
库设计根据靶点/治疗领域设计专属库需要多样性筛选库的企业
类似物扩展围绕先导化合物合成类似物阵列先导化合物优化阶段
补库合成合成商业库中缺失的结构需要特定结构的研究者

4.2 技术能力

  • 合成规模:10 mg - 100 g(可扩展至kg级)

  • 反应类型:涵盖Suzuki、Buchwald、Sonogashira、酰胺缩合、点击化学等主流反应

  • 杂环合成:吲哚、吡唑、嘧啶、喹啉、苯并咪唑等50+杂环骨架

  • 手性合成不对称催化、手性拆分、手性源合成

  • 纯化能力:制备型HPLC、Flash色谱、重结晶

  • 分析表征:NMR(¹H、¹³C)、LC-MS、HPLC、IR、元素分析

4.3 交付内容

每个砌块交付包含:

  1. 化合物样品(纯度≥95%)

  2. 分析报告(HPLC色谱图、MS谱图、NMR谱图)

  3. 结构确认报告

  4. 安全数据表(MSDS)

  5. 储存与处理建议

五、案例:PROTAC专属砌块库

以PROTAC药物研发为例,纳孚生物可提供的专属砌块包括:

E3连接酶配体片段

  • CRBN配体:泊马度胺、来那度胺衍生物

  • VHL配体:VH032类似物及衍生物

  • cIAP配体:Bestatin类似物

连接子片段

  • PEG连接子:PEG2-PEG12不同链长

  • 烷基连接子:C3-C12不同碳链

  • 可裂解连接子:Val-Cit、Val-Ala、SS键

  • 点击化学连接子:DBCO-PEG、Azide-PEG

靶标配体片段

  • 激酶抑制剂片段

  • 受体拮抗剂片段

  • 核受体配体片段

六、服务优势

  • 快速交付:常规砌块2-3周,加急1周

  • 灵活规模:从10 mg筛选到kg级生产

  • 质量保障:每批附带完整分析报告

  • 定制设计:可根据客户需求设计专属砌块库

  • 一站式服务:从砌块合成到生物素标记、荧光标记全覆盖

  • 保密协议:严格保护客户知识产权

联系我们

上海凯康镁科技有限公司

地址:上海浦东新区瑞庆路528号张江医疗器械园

电话:021-58341363     

QQ:1018552257         

邮箱:sale@huaxuedingzhi.com







有机定制合成网 » 分子砌块库设计:高通量筛选化合物的合成与供应方案

咨询化合物定制合成与纳米材料 提供技术支持和售后服务

咨询定制合成 购买化合物产品
在线营销
live chat
no cache
Processed in 0.531871 Second.