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Nat. Chem.|聚糖发夹的合成

分享的是近期发表在Nature Chemistry上的一篇文章——Synthesis of a glycan hairpin。本文通讯作者为马克斯普朗克胶体与界面研究所的Martina Delbianco。本文作者受肽模型系统启发,设计了一种形似发夹的二级聚糖结构——其在多领域有着巨大的潜力,并分别介绍了其设计规则、合成方法和质谱分析。


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首先,作者介绍了氨基酸折叠体的发展成果及其广泛的应用。与之相比,聚糖从未被设计过,在单体数量上有着巨大潜力(100种单糖 vs 20种α-氨基酸)。聚糖有两个吸引人的特点,一个是其有着明确指向的羟基,另一个是自组装。但问题是聚糖合成复杂,缺乏设计原则。在过去,聚糖被认为是柔性分子,很少有二级结构;而最近有证据表明,即使是小聚糖也可以在溶液中有着相对明确的构象——这无疑为聚糖发夹的设计奠定了理论基础。


受肽模型系统启发,作者在水溶液中设计了发夹状二级结构。设计基于天然糖类结构元素的组合,并辅助分子动力学(MD)模拟。自动化糖类组装(AGA)技术提供了快速获得一系列定义明确的糖类序列的途径——其中包括13C标记的类似物,以便进行结构和构象分析。核磁共振(NMR)谱学检测到了远程的核过量效应(NOEs),毫无疑问地证实了合成的糖类发夹结构的存在。

其次,作者介绍了发夹模型。在蛋白质发夹模型中,β-转角作为β-折叠的核心,在平行或反平行方式下将两个链条相邻,并促进链间相互作用(图1)。分子内氢键和侧链相互作用稳定了这一结构单元。

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图1 聚糖发夹的结构



而聚糖与蛋白质不同,其有着富含羟基的骨架,有着自己的新规则:1.聚糖与水相互作用,严重影响了构象,并破坏了分子内氢键;2.长程残基相互作用很少,且缺乏疏水侧链,从而限制了二级结构的稳定性;3.存在巧妙的非共价相互作用,从而影响宏观性质和生物活性

作者选择Lewis X(Lex , α-l-Fuc-(1,3)-[β-d-Gal-(1,4)]-d-GlcNAc) 三糖作为聚糖发夹的出发点(即β转角),因为其有着与肽发夹β转角相似的构象——相当刚性的封闭构象;L-Fuc的甲基与Gal的β面之间的疏水相互作用;非常规CH…O氢键,并因此形成了一个十元环。至于链条,作者选择了纤维素骨架——其在溶液中刚性条状构象、强分子间相互作用、自组装等优秀性质。(图2)总的来说,作者的设计包括一个刚性的转角聚糖,由一个非常规的CH…O氢键稳定,携带两条纤维素聚合物链。在此基础上,作者设计了几种聚糖发夹,并进行了原子级分子动力学模拟预测了其构象倾向。

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图2 聚糖发夹结构单元的选择


随后,作者介绍了聚糖发夹的合成方法——自动聚糖组装(AGA),一种固相自动合成法。该方法使用保护的单糖基建筑块,利用模块循环进行糖基化和去保护修饰,构建成双链结构。最终在固相甲醇解、光化学分离和氢解等步骤后得到了所需的化合物,总收率为10-27%。(图3)

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图3 聚糖发夹的合成


最后,作者介绍了质谱结构分析。转角的关键特征是非常规的的CH…O氢键,而NMR可以检测到这一信息——对于有氢键的结构,可以观察到明显的化学位移增加(图4)。

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图4 化学位移增加


而为了确认在假定的发夹两侧的关键残基之间的空间接近性,作者采用了核奥弗豪瑟效应光谱 (NOESY)实验。在“九糖发夹”中,存在化学位移简并,作者利用AGA反应进行13C标记,并采取了半过滤的1H[13C],1H[12C] NOESY实验,从而得到了合适的信号(图5)。进一步测试中,作者还进行了扩散有序核磁共振波谱学(DOSY)。最终,上述测试都与分子模拟预测一致。

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图5 13C标记的“九糖发夹”


总之,受肽发夹结构启发,作者设计了“聚糖发夹”,由1个转角结构和2个链条结构组成,其中参考Lex的转角结构由非常规氢键稳定,参考纤维素骨架的链条结构由分子内氢键和疏水作用稳定。通过AGA,聚糖发夹得以合成。诸多方法被运用到结构测定中,且结果与分子模拟预测一致。

具有可预测结构的聚糖会大大丰富我们的“操作箱”。一个小小的“聚糖发夹”,能够帮助我们加快聚糖合成领域的步伐,从而更好地进行功能导向合成。


本文作者:WAQ

原文引用:

https://doi.org/10.1038/s41557-023-01255-5

责任编辑:LD




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