有机定制合成网

上海凯康镁科技有限公司 电话:021-51009326 化合物定制询价
专注化合物定制合成服务

Nat. Chem. | 固相合成中的“仿生思想”:模拟核糖体功能的分子反应器用于大空间位阻的多肽合成

分享一篇发表在Nature Chemistry上的文章,题目为“Immobilized acyl-transfer molecular reactors enable the solid-phase synthesis of sterically hindered peptides”,通讯作者是来自南京大学的姚祝军教授和刘发博士,研究方向为天然产物全合成。

1

多肽类药物出于其优良的靶点特异性和良好的生物安全性而备受青睐,但通常面临稳定性差和细胞通透性较差的问题。掺入特定的带有空间位阻的氨基酸已被证明能够用于增强肽的体内稳定性并改善膜通透性。但由于目前固相合成SPPS需要完成从液相活性酯到固相上氨基的两相酰基转移反应,通常需要在合成过程中使用大过量的氨基酸活性酯,同时在面对合成空间位阻较大的多肽时表现出反应速率慢和转化产率低的问题。为了解决这些问题,本文作者借鉴了生物体系中核糖体组装多肽的原理,作为一种不断循环迭代的分子机器,将氨酰基tRNA和肽段tRNA在空间上相互邻近从而促进酰胺键的组装。由此开发了一种模拟核糖体装配多肽的分子反应器(RMMR),以实现固定化树脂上迭代运行的邻近单相酰基转移反应,大幅度提高了空间位阻多肽的合成效率。

在该分子反应器中,包括两个关键组分,一段是“肽锚定点”,用于模拟核糖体上的长肽段tRNA,另外一部分是羧基活化位点,用于活化氨基酸变为活性酯以模拟待组装的氨酰基tRNA。具体合成过程为:首先在DIC等缩合剂的帮助下实现固相上氨基酸活性酯的合成。随后树脂上原本暴露的氨基将会和活化中间体发生缩合反应实现酰基转移,这种酰基转移反应理论上能够在树脂分子内以及分子间发生。随后通过哌啶处理对未反应的活性酯进行淬灭,同时脱去Fmoc基团从而准备下一轮的迭代反应。这样,原本功能化的树脂在此转变成在氨基酸偶联过程中促进酰胺键形成的迭代反应平台。这种反应策略能够显著提高反应物的有效摩尔浓度,并且避免了酰基从溶液相到树脂相的不良扩散过程。

实验部分,作者首先在市售的树脂上进行了改性,通过多种偶联反应在其上添加了用于产生活性酯的亲核基团如HOBt等,得到带有四个活化位点的RMMR树脂,这种改性后的树脂表现出和商业化树脂近似的溶胀能力和稳定性,并通过HPLC等手段证明了在合成常规多肽上表现出和普通商业化树脂相近的性能。

2

随后利用这种改性的RMMR树脂测试了包括含有N-甲基化氨基酸、α,α-二取代氨基酸以及具有刚性的N-甲基化环肽等在内的不同类型多肽的合成,最终发现在合成产率和纯度上都远远优于市售的Rink树脂。这种树脂同样能够适配市面上不同的多肽合成仪,从而方便实现自动化和规模化的生产。

9

总的来说,本文开发了一种模拟核糖体工作原理的分子反应器RMMR,用于合成那些具有较大空间位阻的多肽,表现出比常规SPPS更加优越的性能,扩展了多肽固相合成这一强有力技术的应用场景。


本文作者:SHL

责任编辑:WYQ

DOI:10.1038/s41557-025-01896-8

原文链接:https://doi.org/10.1038/s41557-025-01896-8


有机定制合成网 » Nat. Chem. | 固相合成中的“仿生思想”:模拟核糖体功能的分子反应器用于大空间位阻的多肽合成

咨询化合物定制合成与纳米材料 提供技术支持和售后服务

咨询定制合成 购买化合物产品
在线营销
live chat
cache
Processed in 0.015260 Second.