有机定制合成网

上海凯康镁科技有限公司 电话:021-51009326 化合物定制询价
专注化合物定制合成服务

一种基于二苯甲酮光笼化鸟苷7号位的策略

光笼分子(Photocage)也被称作“光可以去除的保护基团”,是一类含有光敏基团的分子,其可以在特定时间特定位置通过光刺激释放出特定的化合物,以实现特殊的功能。当光笼分子被修饰到底物上,底物的活性会被保护起来,因此在被激活前,底物不会与活性分子反应。而当光笼分子被激活后(通过光照使得光笼分子与底物间的共价键断裂),底物便失去了保护因此可以回复到之前的特性。因为这种独特的性质,光笼分子被广泛地应用于蛋白质、核苷酸、离子、神经传递素、药物、荧光分子等底物的光激活中【ChemBeanGo】。

为了获得对核酸及其生物分子相互作用的光学控制,不可逆光敏化、光致复活化已被广泛应用于核苷、核苷酸和寡核苷酸研究领域。各种对光不稳定的保护基团被引入到寡核苷酸主链或碱基上,并且已经正式在活细胞或生物体中,该保护基团能被特定波长(365nm)的光去除。而邻硝基苄基(ONB)是应用最广泛的一类光笼基团(PC),此外,还有一些从香豆素、喹啉、二苯并呋喃或胡椒基衍生出来的光笼分子也已被报道。

通常来说,PC基团常被引入杂环的环外原子上,如胸苷的4号位氧、胞苷的4号位氮、鸟苷的6号位氧和腺苷的6号位氮等。近期,也有报道杂环的环上也可连接PC基团。在所有的这些例子中,PC基团只取代了一个氢原子,并没有改变核苷的电荷分布。

然而,与迄今发展的用PC基团进行的化学修饰不同,自然界不仅取代氢原子,而且还利用甲基化改变分子的电子结构。在自然产生的m7G、m1A和m3C中,这些修饰使碱基带上正电荷。其中,m7G最为特殊,因为它是1)最保守的修饰核苷之一,2)在不同的生物体内经由多种甲基转移酶(MTases)安装,3)存在于rRNA和tRNA中,以及mRNA中的5帽部分。在后一种情况(帽结构)下,m7G通过多种相互作用,如与翻译起始因子(eIF4E)或脱帽清除酶(dcpS)结合,对调节mRNA的翻译和转换至关重要。因此,明斯特大学的A. Rentmeister课题组报道了利用化学和酶催化两种方式光笼化鸟苷。该研究的亮点之一是,此前从未报道过PC化核苷后能引入正电荷,因为此前往往是通过取代氢原子进行光笼化【Angew. Chem. Int. Ed. 202059, 3161】。

为了验证以上设想,并基于鸟苷7号位氮原子强亲核性,作者首先合成了鸟苷3a (N7-ONB)和3b (N7-PNB)。在365nm激发下,化合物13b均没有变化,但是,化合物3a没有发生预想的光照裂解释放鸟苷1,而是得到化合物4(机理尚不明确)。这些数据表明用ONB基团修饰鸟苷的N7位置后,光裂解产生了一个预期之外的产物而不是鸟苷1,从而限制了其在光笼分子中的应用

随后,作者转而寻找其他光敏基团。苯甲酮(BP)常被应用到生物化学探针领域,而且该基团化学性质稳定、能被360nm附近的紫外光激发。BP上的取代基对光化学有显著影响,吸电子基团能增加氢原子的攫取效率。因此,作者利用BP基团修饰鸟苷N7位置,在365nm紫外光照射下,N7-BP-guanosine 3c能够裂解成鸟苷1和1-甲基二苯甲酮5。为了进一步了解裂解机理,作者对反应缓冲液的组成进行了更详细的测试。在水中,该裂解反应不会发生,而在EDTA、甘油或细胞裂解液中能很好的进行,这表明攫氢的发生与这些缓冲液或细胞裂解液的组分有关。反应机理如Figure2C所示。此外,作者还验证了该BP基团也适用于腺苷的修饰。

为了检验该策略是否可以适用到更复杂的分子,作者选择真核mRNA中存在的标志性帽结构二核苷酸GpppA 8作为底物。由于很难通过化学方法实现二核苷酸GpppA 8的位置选择性的修饰,因此作者设计了酶反应,即利用N7-甲基转移酶(Ecm1)与辅底物S-腺苷甲硫胺酸(AdoMet)共同作用来实现,其中AdoMet能转移各种ONB基团和BP基团,最终得到鸟苷7号位PC修饰的二核苷酸类化合物10a–e(N7-PC-GpppAs)(Figure 3)。在365nm紫外光照射下,与前期鸟苷N7-PC-G结果基本一致,ONB基团的效果依旧不好,PB基团却能够很好的得到光裂解产物GpppA 8

α-羟烷基酮(HAK)取代基是一类能发生Norrish type I自由基裂解的基团,作者用该基团修饰BP基团,继而用于二核苷酸GpppA的修饰(10e)。在312nm激发下,能够得到60%的光裂解产物GpppA 8,并检测到副产物11ea11eb。这些数据表明,HAK基团也能作为鸟苷核苷酸N7位的光笼基团,这说明该方法可以推广到其他芳基酮。

为了验证N7号位正电荷的重要性,作者利用酶反应修饰了腺苷,MTase TaqI和AdoBP 9d对质粒DNA的脱氧腺苷的N6位点进行酶修饰(Figure S31)。与预期的一样,用365 nm紫外光照射缓冲液中的N6修饰的腺苷后,未检测到光裂解反应的发生,因此没有发生随后的酶促质粒的降解。这表明N7位置的正电荷对于芳基酮衍生物的光裂解是必需的。

总之,作者开发了一种通过形成嘌呤亚胺离子的策略去光笼化嘌呤核苷,提出了芳基酮衍生物作为这些嘌呤亚胺位置的新型光裂解基团,例如N7G和N1A,并指出常见的ONB基团并不适合于N7G,开发了化学和酶促光笼和释放N7G。在未来,通过改变芳基酮取代基,光笼化的N7G和N1A可以为进一步改进,如:被长波长光激发和利用BP的双光子激发特性。

 



APPENDICES


Norrish反应(Norrish reaction),又称罗氏反应、Norrish{attr}2244{/attr}、Norrish裂解反应,以化学家 Ronald George Wreyford Norrish 的名字命名。
发生的一类光化学反应。分为 Norrish Ⅰ型裂解与 Norrish Ⅱ型裂解两种类型


有机定制合成网 » 一种基于二苯甲酮光笼化鸟苷7号位的策略

咨询化合物定制合成与纳米材料 提供技术支持和售后服务

咨询定制合成 购买化合物产品
在线营销
live chat
no cache
Processed in 0.435832 Second.