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ChemBioChem:精雕细刻酶的活性位点,强化中链脂肪酸的末端羟化能力

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ω-羟基脂肪酸是许多医药化学品和精细化学品的重要结构砌块,也可以作为单体用于合成聚酯类和聚酰胺类等各种可降解材料,具有广泛的商业和药用价值。细胞色素P450单加氧酶(Cytochrome P450 monooxygenases, CYPs)是一类亚铁血红素依赖的氧化酶,它将氧气中一个氧原子插入底物分子中,另一氧原子生成水分子。以天然油脂来源的中长链脂肪酸为底物,通过P450单加氧酶催化的位置选择性羟化反应合成ω-羟基脂肪酸,符合全球化工产业绿色发展的需求,具有广泛的应用前景。目前已报道的脂肪酸羟化酶中,研究得较为广泛的是CYP153A亚家族单加氧酶。


作者将来源于Sphingomonas sp. HXN-200的CYP153A7 (一种天然催化吡咯烷的P450单加氧酶)进行分子工程改造, 旨在提高其对油酸炼制副产物辛酸的末端羟化活力。基于酶与底物的互作与构效关系分析,采取了以下三种策略:i)选取酶的底物通道4 Å范围内的残基进行丙氨酸扫描;ii)探究酶的底物口袋周围与底物羧酸基团相互作用的残基,选取突变点;iii)将CYP153A7与同亚家族酶进行结构和序列比对,选取突变点。突变所得最优变体的催化效率相较于母本提高了3.8倍,半致死温度(T5010)提高了4℃。此外,基于酶的分子动力学模拟,作者通过键能、残基互作、基团间距离变化等因素分析,对该酶改造过程中的催化活性与稳定性提升的机理进行了初步分析,为该类酶的后续改造与应用研究奠定了良好基础。

图1. 辛酸末端羟化酶CYP153A7的分子工程改造

图2. CYP153A7分子改造后催化性能提升的分子机制

最后,作者考察了CYP153A7的有益变体对中短链脂肪酸底物(C6:0-C12:0)的催化性能,弄清了其脂肪酸底物谱,且发现变体(D258E)对C8:0-C12:0脂肪酸的羟化能力相较母本均有提高。CYP153A7及其变体催中短链脂肪酸末端羟化的探究结果,可以指导未来针对其它脂肪酸的蛋白质工程改造,提升酶的活力。

文信息

Carving the Active Site of CYP153A7 Monooxygenase for Improving Terminal Hydroxylation of Medium-Chain Fatty Acids

Ya-Li Dong, Gang-Gang Chong, Dr. Chun-Xiu Li, Prof. Dr. Qi Chen, Dr. Jiang Pan, Prof. Ai-Tao Li, Prof. Jian-He Xu

上述工作由硕士研究生董亚丽(第一作者)担纲,通讯作者是许建和教授。该课题得到国家自然科学基金委重点项目(21536004)和国家重点研发计划项目(2019YFA09005000)的资助。


ChemBioChem

DOI: 10.1002/cbic.202200063


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